Program Studi Ilmu Kedokteran Klinik sampai saat ini mempunyai minat utama :
Kelompok Minat Utama MS – PPDS
- MS – PPDS Ilmu Kesehatan Anak
- MS – PPDS Patologi Klinik
- MS – PPDS Radiologi
- MS – PPDS Ilmu Kedokteran Jiwa
- MS – PPDS Forensik dan Medikolegal
- MS – PPDS Dermatologi, Venereologi, dan Estetika
- MS – PPDS Kedokteran Keluarga Layanan Primer
- MS – PPDS Onkologi Radiasi
Kelompok Minat Utama Non MS – PPDS
- Minat Utama Epidemiologi Klinik
Minat Utama Epidemiologi Klinik dirancang untuk diselesaikan dalam 4 (empat) semester. Dua semester pertama digunakan untuk memperoleh masukan mengenai ilmu dan teknologi yang dibutuhkan, pada 2 (dua) semester berikutnya sebagai bekal untuk menyelesaikan proses penyusunan proposal dan penelitian. Program Epidemiologi Klinik dapat ditempuh paling singkat tiga (3) semester dan paling lama delapan (8) semester.