Tahapan studi selama menempuh pendidikan Magister Ilmu Kedokteran Klinis (MIKK) terdiri dari beberapa tahapan sebagai berikut.
1. Minat Utama Non MS-PPDS (Minat Utama Epidemiologi Klinik)
1. Perkuliahan
2. Seminar Proposal
3. Seminar Hasil Penelitian
4. Ujian Akhir Tesis
5. Yudisium
6. Wisuda
A
2. Minat Utama MS-PPDS
1. Mahasiswa Aktif MS pada Semester 1
Perkuliahan MS
2. Mahasiswa Aktif MS dan PPDS pada Semester 2
Perkuliahan MS dan PPDS, seminar Proposal MS
3. Mahasiswa diberi cuti akademik 4 semester dari MIKK pada semester 3-6, PPDS tetap Aktif
4. Mahasiswa Aktif MS dan PPDS pada semester 7 sampai dengan selesai.
Perkuliahan MS, Seminar Proposal MS, Seminar Hasil MS, Ujian Akhir Tesis MS, PPDS tetap Aktif
5. Yudisium MS
6. Wisuda MS